Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn15Q9JLG8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn15Q9JLG8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms