Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra4Q9JJT2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms