Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efcc1Q9JJF6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms