Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2ird1Q9JI57 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2ird1Q9JI57 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2ird1Q9JI57 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2ird1Q9JI57 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2ird1Q9JI57 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2ird1Q9JI57 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2ird1Q9JI57 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2ird1Q9JI57 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2ird1Q9JI57 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2ird1Q9JI57 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2ird1Q9JI57 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gtf2ird1Q9JI57 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms