Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ropn1lQ9EQ00 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms