Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms