Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clstn1Q9EPL2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms