Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp13a1Q9EPE9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms