Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Xab2Q9DCD2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms