Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pop5Q9DB28 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms