Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Scp2d1Q9DAH1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Scp2d1Q9DAH1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Scp2d1Q9DAH1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Scp2d1Q9DAH1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Scp2d1Q9DAH1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Scp2d1Q9DAH1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Scp2d1Q9DAH1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Scp2d1Q9DAH1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Scp2d1Q9DAH1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Scp2d1Q9DAH1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Scp2d1Q9DAH1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Scp2d1Q9DAH1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Scp2d1Q9DAH1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Scp2d1Q9DAH1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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