Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rsph3bQ9DA80 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms