Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot8Q9D8X5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms