Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rexo2Q9D8S4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms