Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

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Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf225Q9D7D1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf225Q9D7D1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf225Q9D7D1 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf225Q9D7D1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf225Q9D7D1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf225Q9D7D1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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