Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rtl8cQ9D6I0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms