Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm5Q9D6G9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms