Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdr42e1Q9D665 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr42e1Q9D665 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr42e1Q9D665 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr42e1Q9D665 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr42e1Q9D665 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr42e1Q9D665 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr42e1Q9D665 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdr42e1Q9D665 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms