Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt34Q9D646 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt34Q9D646 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms