Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zc2hc1bQ9D534 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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