Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc83Q9D4V3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc83Q9D4V3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms