Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rasgef1cQ9D300 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1cQ9D300 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1cQ9D300 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1cQ9D300 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1cQ9D300 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1cQ9D300 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1cQ9D300 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms