Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chordc1Q9D1P4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms