Protein–RNA interactions for Protein: Q9D061

Acbd6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd6Q9D061 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Acbd6Q9D061 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Acbd6Q9D061 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Acbd6Q9D061 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Acbd6Q9D061 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Acbd6Q9D061 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Acbd6Q9D061 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acbd6Q9D061 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms