Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms