Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ube2fQ9CY34 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ube2fQ9CY34 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms