Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tdrd12Q9CWU0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms