Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lhfpl3Q9CTN8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms