Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pard3bQ9CSB4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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