Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ykt6Q9CQW1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ykt6Q9CQW1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ykt6Q9CQW1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ykt6Q9CQW1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms