Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rnaseh2cQ9CQ18 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnaseh2cQ9CQ18 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms