Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Commd4Q9CQ02 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms