Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CPS8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CPS8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q9CPS8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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