Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2a1Q99PM3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms