Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NsmfQ99NF2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms