Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

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Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp26Q99MX1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Usp26Q99MX1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Usp26Q99MX1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp26Q99MX1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms