Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncaipQ99ME3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SncaipQ99ME3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms