Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdca3Q99M54 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdca3Q99M54 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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