Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pacsin3Q99JB8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms