Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ddb2Q99J79 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ddb2Q99J79 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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