Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Csmd1Q923L3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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