Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Spdl1Q923A2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdl1Q923A2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms