Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubxn1Q922Y1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn1Q922Y1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms