Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Afg3l1Q920A7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms