Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pde6cQ91ZQ1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6cQ91ZQ1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6cQ91ZQ1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6cQ91ZQ1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6cQ91ZQ1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pde6cQ91ZQ1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6cQ91ZQ1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pde6cQ91ZQ1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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