Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps36Q91XD6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms