Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klc3Q91W40 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klc3Q91W40 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms