Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDM4

Psmd2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd2Q8VDM4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd2Q8VDM4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd2Q8VDM4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms