Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Sgms1Q8VCQ6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Sgms1Q8VCQ6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Sgms1Q8VCQ6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Sgms1Q8VCQ6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Sgms1Q8VCQ6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Sgms1Q8VCQ6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Sgms1Q8VCQ6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sgms1Q8VCQ6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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