Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BbxQ8VBW5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms